除了经典的核糖核苷酸A、U、C、G，生物体内还有大量的遗传修饰核苷酸，即所谓的表观遗传修饰。它们像篱笆上的灯笼一样装饰着RNA，调节着基因表达、mRNA剪接、疾病发生等各种重要的生命过程。

到目前为止，科学家已经成功鉴定了170多种表观遗传修饰，但这些只是冰山一角。为了在转录组水平实现完整修饰的作图，自然细胞生物学和分子生物学的封面综述呼吁开发一种方法来直接定位和定量RNA的所有表观遗传修饰。

RNA修饰分析可以通过薄层色谱（TLC）、高效液相色谱-紫外分光光度法（HPLC-UV）或高效液相色谱-质谱（HPLC-MS）进行。这些方法可以同时测量大量的RNA修饰，但很难提供序列信息。基于第二代测序（NGS）的方法可以通过抗体免疫沉淀或化学修饰来绘制整个转录组的RNA修饰图谱。这些方法只能检测有限种类的修改，并且通常只针对一种特定的修改。仍有大量的RNA修饰无法检测或定位。